Le monométhylmercure (MMHg) est une neurotoxine bioampnifiable préoccupante à l’échelle mondiale dont les risques pour la santé humaine sont principalement associés à la consommation de poisson. On sait que les réservoirs hydroélectriques sont des sources de MMHg de nombreuses années après leur mise en eau. On sait cependant peu de choses sur les barrages au fil de l’eau qui inondent de plus petites zones terrestres, bien que leur nombre devrait augmenter considérablement dans le monde entier dans les décennies à venir. La production de MMHg est associée principalement à des processus anaérobies, mais il a été démontré que la méthylation du mercure se produit dans les biofilms périphytes situés dans les zones oxiques de la colonne d’eau. Par conséquent, dans cette étude, nous avons étudié la production in situ de MMHg par les communautés périphytes dans les habitats touchés par la construction d’un barrage au fil de l’eau en combinant des mesures du taux de transformation avec des approches génomiques ciblant les gènes hgcAB, responsables de la méthylation du mercure. Ces résultats fournissent des connaissances approfondies sur les méthylateurs du mercure dans les écosystèmes fluviaux touchés par les barrages au fil de l’eau dans les habitats tempérés.